1899年，章太炎第一次流亡日本，在此期间，他认识了孙中山，两人关于“若是改朝换代，该定都何处”这一问题展开了探讨，孙中山列出了武昌、西安、伊犁三个城市。章太炎将孙中山所言记录在其《訄书》之中，正所谓：“谋本部则武昌，谋藩福则西安，谋大洲则伊犁。
1912年元旦，我终于回到了祖国，参加了在南京举行的临时大总统就职仪式，宣布了中华民国的成立。然而，一开始我的理想都城并非南京，早在1902年，我曾经说过:如果我们成功推翻封建帝制，建立新的国家，我希望把首都设在伊犁。
孙中山关于中国首都的曾有一句有名的豪言：此后建都，谋本部则武昌，谋藩服则西安，谋大洲则伊犁，视其规摹远近而已。翻译过来是，中国若想本部安定就定都武昌（武汉三镇之一），想民族和谐就定都西安，若要雄踞亚洲则需定都伊犁，至于具体定都哪里，则要根据中国的实力而定。
我们来回顾一下当年国M党选择首都的一段插曲，孙中山说“金陵犹不可宅”，在中国的东部，地域上离上海太近，在经济和政治上非常容易受到洋人的牵制，并且这里鱼米之乡，秦淮河畔，歌舞升平的地方，在这里咿咿呀呀的温柔乡里，容易削弱奋斗者的斗志。
很多人对孙中山先生的三个设想非常不以为然，认为第一个设想就已经非常荒谬了，武昌既不是四大文明古都，也称不上极尽繁华，在当时顶多算是一个区域中心，但如果就此认为，仅仅是因为辛亥革命最早发生在武昌，所以孙中山先生才对武昌情有独钟，无疑是对孙先生的不尊重，孙中山先生之所以要定都武昌，和一句古话有关，那就是“民亦劳止，汔可小康;惠此中国，以绥四方”。
中华民国建立后，孙中山将临时政府设在了南京，后来袁世凯窃取革命果实后，违反了《临时约法》，将他的大本营北京设为首都。不过，孙中山一开始的首都之选并不是南京。在《与章太炎的谈话》中，他指出：“谋本部则武昌，谋藩服则西安，谋大洲则伊犁。
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