盘古开天辟地之后，魂魄号为元始天王，经由太元玉女生下，就是元始天尊。三清皆是元始天王所化。当初天地尚未开辟，天地日月都没有成型，整个世界一团混沌，就像一个鸡子，里面孕育着一个叫做盘古的巨人，盘古睡了一万八千年，有一天终于醒了过来，他晃晃身子，站了起来，混沌一团的宇宙顿时炸裂开来。
《》第一次提到元始天尊是在出世时，因为哪吒乃灵珠子转世，他是衔使命出生的，一出生便注定以后要当伐纣的先行官，而这个使命便是元始天尊赋予的，所以元始天尊特意派白鹤童子持玉札到乾元山金光洞，命太乙真人送灵珠子下山。
在道教文学作品中，元始天尊被塑造为最高的神祇之一，《大洞真经》中描述了元始天尊在道教三清神祇中的地位:“玉宸道君者乃大道之化身也。主掌太玄辅之位，妙道玉京山紫微宫中，含先天之炁而育养群灵，为诸天之王长存不没。其气始青，号曰玉宸道君。”
相传盘古治世， 功成崩逝， 灵魂脱壳而出，离开身体， 一灵不昧，游行于空中， 因念游魂无赖， 必须再凭父母精炁成形， 投胎转世，方不失本来面目， 如不从胞胎孕育，终是清虚之炁而已， 有一次灵魂随风飘至弗于逮， 见一太元圣女， 四十馀岁， 独自在嵯峨山中， 餐霞伏炁， 圣女每天到峰头採取日月精华， 盘古喜其贞节， 趁太元圣母仰天呼吸之际， 化为清光， 投进她的口中， 怀孕十二年， 始化生于脊旅之间， 卽是元始天尊。
