本作有四个结局，分别是八百万神路线、维护秩序路线、破坏王座路线和创造没有神魔的世界，除了真结局路线以外流程中的任务对话基本不影响剧情分歧，在打败梅塔特隆、进入至高天之后通过路西法的天之声可以选择分歧，建议打完梅塔特隆之后存个档。
