1、starBase一个高通量实验数据CLIP-Seq(或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP)和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA,miRNA-ceRNA 和R
随着非编码蛋白的competing endogenous RNAs (ceRNA)的研究越来越热,如何将mRNA表达量及ceRNA结合起来,并进一步深入探讨ceRNA调节mRNA表达的机制逐渐成为研究热点。
研究利器之“ OncoLnc”:TGCA数据挖掘工具导语oncoLnc是一个交互式工具可以探索生存相关性,下载临床数据后,将其与mRNA,miRNA和lncRNA表达数据进行偶联分析。oncoLnc的特点oncoLnc的网址:http://www.oncolnc.
探索生信之美,解构每一篇文章的故事更多数据库干货知识私信我回复“数据库”即可免费领取哦解读文献之美,探索生信逻辑~大家好呀,我是风间琉璃,咱们又见面啦。2021年刚开年就发生了很多事情,跌跌撞撞就到了三月。
有很多网友说分享一下如何用生信+实验分析miRNA发SCI的方法,所以这次就分享一下使用TCGA数据挖掘+细胞实验分析miRNA发SCI的思路,本次参考范文题目:Let-7i-5p enhances cell proliferation, migration and invasion of ccRCC by targeting HABP4,该文章发表在BMC Urology上,影响因子:1.592,中科院最新分区:4区,审稿周期:3-4个月,版面费:$2390.00,不在中科院《国际期刊预警名单》名单上。
转录后调控是指在RNA转录后对基因表达的调控,是真核生物基因表达的特点之一。RNA家族作为科研界的后起之秀,一直备受瞩目。而近年来,除了魅力不减当年的miRNA、炙手可热的lncRNA,ceRNA假说也随之出现,逐渐成为研究的热点!
《Neuron》IncND通过Notch通路调控神经发育导语加州大学圣巴巴拉分校(下文简称UCSB)分子与细胞神经生物学实验室的研究发现一个长链非编码RNA(IncRNA)能够调节神经发育(ND),被命名为IncND。这项研究发表于期刊《神经元》(Neuron,影响因子:13.
研究利器之"RNALocate":RNA亚细胞定位检索工具导语在8月19号《核酸研究》 网络版发表了哈尔滨医科大学,电子科技大学以及汕头医科大学共同开发的RNA亚细胞定位工具RNALocate,该工具整合了大数据资源,大大方便科研人员检索各种RNA分子的亚细胞定位以及后续预测方法
文章来源:Huang HM, Chen GS, Liu ZY, Meng QL, Li JH, Dong HW, Chen YC, Zhao F, Tang XW, Gao JL, Chen XM, Cai YX, Zheng YQ Age-related hearing loss accelerates the decline in fast speech comprehension and the decompensation of cortical network connections. Neural Regen Res 18:1968-1975.
目录:一,ceRNA假说二、常规操作三、团结一切可以团结的力量四、没有条件创造条件五、1+1=2,得不偿失六、趋势和选择七、相关的数据库和工具最近听小伙伴说关于ceRNA的研究又多了起来。其实做ceRNA 的无非两种:一种是ceRNA太重要,没得选;一种是不知道做什么,没得选。