小果今天给大家带来的是Cytoscape的相关使用方法，Cytoscape是一个用来美化蛋白互作网络的工具，相信很多小伙伴已经掌握了Cytoscape的基本使用方法，那今天就让我们来进阶一下吧，用Cytoscape来计算一下蛋白互作网络的各个指标。
【gene symbol:】栏填入TOP2A，【Cancer Types】栏选择LIHC，【Immune Infiltrates:】栏选择B Cell， CD8+T Cell， CD4+T Cell， Neutrophil，点击Submit。
抑郁症是一种常见的精神健康障碍，病因复杂，具有发病率高、复发率高的特点。从GeneCards数据库以“relevance score”>1.402 368 307为筛选条件，获得了2 259个抑郁症治疗靶点;
以下是文章原文对图的注解:GSEA analyses of genesets for cardiac and endothelial/endocardial development. NES， normalized enrichment score. FDR， false discovery rate. Positive and negative NES indicate higher and lower expression in iwt， respectively.
R 4.1.0、ClusterProfiler 4.10.3、DOSE 3.26.2、Limma 3.58.1、ggplot 2.3.3.0、enrichplot 1.6.1、Cytoscape 3.7.2等软件。
随着我国经济生活水平提升，糖尿病及其并发症患病率逐年攀升，糖尿病足溃疡是DM常见并发症之一，占DM患病人数的6.4%，50%~60%的DFU患者会发展为糖尿病足感染，15%患者最终面临截肢风险，而50%以上因DFU截肢的患者其死亡率显著提升，超过多数癌症，给个人、家庭及社会带来沉重经济和精神负担。
1.数据收集与microRNA选择：GEO(Gene Expression Omnibus, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)可查询基因序列、RNA&DNA& ChIP测序结果。利用关键词搜索相关基因表达谱。2.
众所周知，医生做科研很难，发SCI更难。基础研究，临床研究与生信研究都属于医生做科研的技能分支。大部分医生做科研的主线是搞基础研究，通过做实验来产出数据，但是基础研究做的过程很费时间，数据产出的过程需要各种实验技巧，门槛相对较高。
富集分析是生物信息分析中快速了解目标基因或目标区域功能倾向性的最重要方法之一。这就是常说的GO富集分析或KEGG富集分析，可以做的工具很多，GOEAST是其中一个最好用的在线功能富集分析工具，数据库更新实时，操作简单，并且可以直接用之前介绍的方法绘制DotPlot。
英文检索词为“heart failure with preserved ejection fraction”“heart failure with normal ejection fraction”“diastolic heart failure”“Chinese medicine”“traditional Chinese and western medicine”“Chinese patent medicine”“medical case”“decoction”“pill”“powder”。
肺癌是全球范围内导致癌症相关死亡的最主要原因，据统计，每年约180万人死于肺癌。既往研究认为吸烟和遗传因素是肺癌发生的重要原因，然而，近年来诸多研究发现，越来越多的肺癌患者无吸烟史和家族史，因此促使了其他重要环境促癌因子的发现。
