中国工程院院刊《Engineering》2022年第9期发表黑龙江中医药大学王喜军教授研究团队的《基于整合临床和动物实验的小分子筛选平台揭示经典方剂茵陈蒿汤治疗黄疸证显效状态下的活性化合物及潜在作用靶点》一文。
今天跟大家分享的是一月份发表在Aging (IF:5.515)杂志上的一篇文章Prognostic value of epithelial- mesenchymal transition markers in clear cell renal cell carcinoma。
两三年前,纯生信文章随便下载个GEO/TCGA数据,简单做一下差异分析、GO分析、KEGG分析、PPI分析、生存分析就可以发表了,然而这样的日子很短,随着越来越多人加入到生信数据挖掘的大军中,这样的纯生信文章一天比一天多,内卷一天比一天严重,扎堆投稿日益严重,常规分析套路越来越难发表。
随着我国经济生活水平提升,糖尿病及其并发症患病率逐年攀升,糖尿病足溃疡是DM常见并发症之一,占DM患病人数的6.4%,50%~60%的DFU患者会发展为糖尿病足感染,15%患者最终面临截肢风险,而50%以上因DFU截肢的患者其死亡率显著提升,超过多数癌症,给个人、家庭及社会带来沉重经济和精神负担。
本研究 PPI 网络分析结果显示EGFR、CTNNB1、UBC、YWHAZ、PRS27A、HSP90AB1等 靶 蛋 白 与细胞的转化生长以及细胞间的黏附有密切关系,与炎症、肿瘤、癌症等疾病的发生与转移密切相关,如HSP90AB1在肺癌组织中的表达水平显著高于在正常肺组织中的表达。
文题释义:网络药理学:是基于系统生物学的理论对生物系统的网络分析,选取特定信号节点(Nodes)进行多靶点药物分子设计的新学科。网络药理学强调对信号通路的多途径调节,提高药物的治疗效果,降低毒副作用,从而提高新药临床试验的成功率,节省药物的研发费用。
网络药理学:网络药理学是围绕生物信息学、系统生物学等学科的技术和知识,并在网络数据库检索基础上,进行生物信息网络的构建和分析,可构建药物的“成分-靶标-通路-疾病”网络,深入探究药物与疾病的关系,阐明药物的作用机制。
北沙参Glehniae Radix为伞形科植物珊瑚菜Glehnia littoralis Fr. Schmidt ex Miq.的根,分布在中国河北、山东、江苏、浙江、福建、台湾等地,当前主产区为内蒙古、河北和山东。
商陆始载于《神农本草经》,为商陆科植物商陆Phytolacca acinosa Roxb. 或垂序商陆P. americana L. 的干燥根,具有逐水消肿、通利二便的功效,外用可解毒散结,主治水肿胀满、二便不通、痈肿疮毒等症。现代药理研究发现,商陆具有抗菌、抗病毒、抗炎、抗肿瘤、增强免疫、祛痰平喘等作用。
引用本文:古玉凤, 邓丙英, 李倪仁, 曾译萱, 鲁思凡, 朱 晨, 陈 磊, 刘 怡. 苦参总黄酮改善非酒精性脂肪肝的作用机制及斑马鱼实验验证. 中国组织工程研究, 2025, 29: 2969-2978.
1 数据库及可视化分析软件 有效成分及靶点数据库 TCMSP、Similarity ensemble approach、SwissTarget Prediction、GeneCards、DisGeNET;