geo数据库怎么直接找基因

资讯

吐血整理的GEO数据库知识，生信小白你确定不看看？
但是作为一个生信小白你是否对GEO还是满脑袋问号，不知道该怎们用呢?今天小编就吐血整理了关于GEO数据库的相关问题，都是你可能会遇到的哦，希望对你有帮助。
云生信学生物信息学
GEO公共数据库中4例多指畸形患者细胞间质和上皮细胞的单细胞转录组分析
关键词: 多指畸形，转录因子，生物信息学，单细胞转录组分析，微环境， Heghog信号通路，大数据分析。
中国组织工程研究杂志
GEO入门教程 | 如何利用GEO数据库筛选适合自己的数据集
1 GEO Platform 芯片平台。2 GEO Sample 样本ID号。GEO提供了3种格式的数据:1. SOFT formatted family file。
医思倍生物医学
没想到吧？NCBI竟然还有这么多实用功能！新技能get……
俗话说“工欲善其事，必先利其器”，与其在那一个人死磕，还不如掌握一些实用的科研工具，搞起科研来说不定有事半功倍的效果!
解螺旋
3评论
SCI发文时常用数据库汇总（基因组研究），收藏
通过数据库可搜索到自己感兴趣的基因在患者样本中的突变情况，还会提供基因的基本信息和一些注释，包括该基因参与的通路以及相应的GO注释等。最重要的是该数据库可以查看在某种癌症中基因突变的排名情况，从而据此做一些相关研究。
SCI论文专家
3评论
差异分析，你还在使用GEO2R吗？
GEO虽是一个宝库，但是使用GEO进行数据分析可不是一件简单的事!首先，GEO的数据检索非常不方便，例如，我想获取有预后信息的乳腺癌数据，显然使用GEO官方检索起来很难。
概普生信
独木成林，小果教您用genemania把少量基因做成PPI网络图
PPI网络图是生信分析中的常见图，它可以反应一些基因蛋白之间的相互关系，但一般来讲，做网络图，需要足够多的基因，正所谓独木难成林嘛。
云生信学生物信息学
1评论
双疾病纯生信分析6分+WGCNA和机器学习鉴定诊断基因+关键信号通路
小云之前给大家分享过多篇双疾病的研究思路，文章内容都是相对简单且常规，但影响因子丝毫不差。杂志:Frontiers in cell and developmental biology。
云生信学生物信息学
如何查找“铁代谢”相关的基因？
我们通过重复这3篇文章的方法，发现文章《Iron metabolism-related genes reveal predictive value of acute coronary syndrome》的GSEA检索结果大概是直接使用iron作为关键词检索获得的51个基因集，由于没有经过人工查看过滤，虽然基因个数最多，但是可靠性稍微差点。
微生信
阿尔茨海默病免疫标志物及靶向药食同源中药预测
阿尔茨海默病又称原发性变性痴呆，常发生于老年人，是一种具有不可逆性和致死性的中枢神经系统退行性病变，常伴有进行性认知障碍、记忆缺陷、人格和行为改变等症状表现，严重影响患者的生活质量。
天津中草药
4评论
【论著】基于生物信息学的2型糖尿病患者内脏脂肪差异表达基因分析
引用本文:李颖，卢家香，何璐，等 . 基于生物信息学的 2 型糖尿病患者内脏脂肪差异表达基因分析.中华健康管理学杂志， 2024， 18: 910-915. DOI: 10.3760/cma.j.cn115624-20240829-00693.
中华健康管理学杂志
差异表达基因联合加权共表达网络分析筛选骨关节炎滑膜中的关键基因
关键词: 骨关节炎，滑膜组织，差异表达基因，加权共表达网络分析，细胞应激反应，信号通路，激活转录因子3，双特异性磷酸酶1。
中国组织工程研究杂志
1评论
类风湿关节炎铁死亡特征基因CeRNA网络构建及免疫表现
引用本文:夏天，李炳霖，肖发源，郑恩泽，陈跃平. 类风湿关节炎铁死亡特征基因CeRNA网络构建及免疫表现. 中国组织工程研究， 2024， 28: 2561-2567.
中国组织工程研究杂志
2评论
m6A相关基因在激素性股骨头坏死中的生物信息学分析
关键词: 激素性股骨头坏死， m6A甲基化，微小RNA，转录因子，生物信息学，差异基因，基因调控网络，核心基因。
中国组织工程研究杂志
科研小白生信文章写作中常见的问题与解决方法
新手小白在学习的过程中总会遇到一些很基础的问题，今天小薇就把自己刚开始学生信分析以及文章写作中遇到的问题简单给大家汇总一下，还附带了解决办法哦。
云生信学生物信息学
3评论
别不信！近4分的非肿瘤套路，我用一刻钟零代码就可以复现
Bioinformatic Analysis Identifies Potential Key Genes in the Pathogenesis of Turner Syndrome。
解螺旋
4评论
结合2020年5月5+SCI，一文总结干湿结合生信套路，史上最全
今天要给大家拆解的文献是今年5月刚刚发表在Aging上的文章，影响因子5.515。文章题目是Identification and validation of hub microRNAs dysregulated in esophageal squamous cellcarcino
解螺旋
种植体周围炎炎性组织差异表达基因的筛选及验证
引用本文: 韦雨杏，董皓，韦惠平，谢诚，陀杨娟，覃浩，曹勇. 种植体周围炎炎性组织差异表达基因的筛选及验证. 中国组织工程研究， 2023， 27: 4844-4849.
中国组织工程研究杂志
科研小技巧（1）之无生信，照样画出CNS图
打开NCBI数据库，选择GEO DataSets，检索文章中的数据库编号 GSE149268。11.点击左侧各数据，选择 Set Data Range。
科研小白EP
3评论

加载更多

视频