肾主藏精、藏命门之火：肾储藏五脏六腑的精气，储藏具有生殖作用和能促进生长发育的肾精，人体发育成长直至衰老死亡的过程，便是肾气盛衰的过程。命门附着于肾，藏“真”火，称之为命门之火，所以肾又藏命火。肾精与命火，一阴一阳，相辅相成，即肾的生理功能。
肾肾有左右两枚，位于腰部脊柱两侧，在五行属水，为阴中之少阴，肝与四时之冬季相通应。肾的主要生理功能为：肾藏精，主水，主纳气。在体合骨，主骨生髓，其华在发，开窍于耳及二阴。肾藏精是指肾具有贮存、封藏人体精气的生理功能。
纳，固摄、受纳的意思。肾主纳气，是指肾摄纳肺吸入的清气而维持正常呼吸的功能。人体的呼吸运动，虽为肺所主，但吸入之气，必须下归于肾，由肾气为之摄纳，呼吸才能通畅、调匀。“气根于肾，亦归于肾，故曰肾纳气，其息深深。”正常的呼吸运动是肺肾之间相互协调的结果。
