除晚期智人以外,人类谱系中还有相当多的亚种,已发现的亚种可达几十种,有LD 350-1,纳莱迪人,魯道夫人,能人,格鲁吉亚原人,匠人,豪登人,直立人,先驱人,西布兰诺人,罗德西亚人,海德堡人,尼安德塔人,佛羅勒斯人,吕宋人,澎湖原人,丹尼索瓦人,龍人,長者智人,馬鹿洞人等。
虽然猿人已经跟人类很相似了,但在分类学上,人类被列为人科,而类人猿则被列为类人猿科,这是因为二者有本质性的区别。二者主要区别是是否能够直立行走。人类实现直立行走不但使形态特征区别于猿人,更重要的是,直立行走使得双手解放出来,可以用来制造和使用工具。