1683年 ，水师提督施琅平定台湾，实现了统一。但在清政府内部就台湾的弃留问题展开了激烈争论。而且朝廷多数官员也都认为，台湾土地狭小，人口稀少，财赋无多，又远隔重洋，如派兵驻守，不仅糜费粮饷，而且鞭长莫及，所以主张“守澎湖，徙台湾人民而弃其地”。
公元1895年，随着号称“亚洲第一海军舰队”的北洋水师全军覆没，北洋水师提督丁汝昌自杀殉国，这也就意味着，清朝政府在中日甲午战争中彻底失败。无奈之下，掌管清朝最高权力的慈禧太后，只好派出时任直隶总督李鸿章前往日本马关进行和谈，被迫签署了一份丧权辱国的《马关条约》。
也正是因为清廷在收复台湾前并未考虑如何善后，康熙二十二年6月26日，负责收复台湾的施琅在攻克澎湖后，即在向康熙报捷的《飞报大捷书》中提出了台湾弃留问题，“克扫之后，或去或留，臣不敢自专。合请皇上睿夺，或遴差内大臣一员来闽，与督臣商酌主裁，或谕令督抚二臣会议定夺，俾臣得以遵行。”
