这个词一般就代表这篇文章数据上传到NCBI的数据编号,GSE是基因表达数据库,我们先找到这个文章的项目号PRJNA340947,然后找到找SRA数据编号SRP083700,然后选择一个数据下载比如这个SRR4098209, 点Run→Data access,最后随便用什么下载上传到服务器就可以了。
然而,其在日常培养和分化过程中,常常会发生二倍化现象,严重影响其发挥“基因筛选利器”的功能。因此,在自然情况下,细胞中具有两套染色体,这也是哺乳动物传递遗传信息的方式,并通过减数分裂来抵御环境变迁,保障物种繁衍。
核糖开关是信使RNA(mRNA)上的微小的结构元件,它可根据特定的环境暴露改变构象,这些变化可以改变转录或翻译。这样的核糖开关在细菌的基因调控上是一个重要的因素。然而,这样基于RNA的调节对于研究来说还是具有挑战性的,一部分的原因是缺少有效的高通量技术对其不偏不倚地进行鉴定。
为了克服传统培养技术的不足,充分研究和开发新微生物活性物质,研究者们发展了宏基因组学技术。宏基因组 是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名词, 其定义为“the genomes of the total microbiota found in nature” , 即环境中全部微小生物遗传物质的总和。
在“Comparative Transcriptome Analysis of the Climacteric of Apple fruit Uncovers the Involvement of transcription factors affecting ethylene biosynthesis”一文中,作者为了鉴定苹果果实贮藏过程中差异表达的转录因子,明确它们调控苹果果实贮藏过程中乙烯合成的模式。
该基因集基于团队获得的264 个阴道拭子样本的宏基因组数据和 308 个阴道细菌菌株的全基因组序列测序数据构建,最终含有在阴道中活跃的细菌、病毒和真菌的大约一百万个基因的序列,代表了阴道中存在的 300 多个不同的物种。
在生态系统中,微生物的存在就像空气。它们维持着生态平衡、促进着物质循环,它们还能消化食物、防御疾病、驯化免疫系统等,直接或间接地参与人类生命活动的全过程。它们隐而不现,却不容忽视,像一位潜藏的“主宰者”。