从字面意思来看，毒是毒素，首先这个病源能产生毒素，毒素可以穿过肠道壁，进入血液，造成内毒素升高。之所以叫做综合症，是因为肠毒不是单一病源造成的，肠毒综合症是一种由多病引起的肠粘膜发炎，增厚，脱落，坏死等变化的综合性病症。
粪便变化:红色预示球虫，白色粘糊状预示白痢，白色稀粪石灰水样预示通风，传染性法氏囊，肾传支，其他可引起尿酸盐代谢障碍的疾病，硫磺样预示盲肠肝炎黑头病，组织滴虫病，黄绿色带粘液预示新城疫，霍乱，伤寒，螺旋体，白细胞原虫病等，水样稀薄预示饮水过多，饲料中镁离子过多，轮状病毒感染，细长条有粘性是慢性球虫病。
细菌能引起肠炎，如沙门氏菌、产气夹膜梭菌等，通过刺激破坏肠道黏膜，同时引起炎症使肠蠕动速度加快，消化液排泄过多，饲料通过消化道的时间缩短，导致消化不良。病鸡主要特征是呼吸困难，下痢，神经机能紊乱，黏膜和浆膜出血，出血性纤维素性坏死性肠炎等。
