其致病菌大多数为革兰阳性菌，分枝杆菌及真菌等非典型致病菌发病率低，但诊断困难，病死率高，预后差。分枝杆菌种类较多，可分为结核分枝杆菌复合群、非典型分枝杆菌、麻风分枝杆菌等，其中结核杆菌是引起结核病的病原菌，可侵犯全身各器官，结核分枝杆菌与相关的分枝杆菌菌种形成结核分枝杆菌复合群。
