郭云深文武双全，不仅拳法独步一时，又熟练兵书，对形意拳理论，进行过系统的研究和总结，遗著有《能说形意拳经》一书。对形意拳理论的论述，其要点如下：“形意拳有三层道理，有三步功夫，三种练法。三层道理是：一练精化气，二练气化神，三练神还虚。三步功夫是：一易骨，二易筋，三易髓。
在修炼金液大丹的过程中，首要任务是安炉立鼎。这里的鼎并非金属或铁制，炉也不是玉石或石头。因此，青霞子说:“鼎并非金鼎，炉并非玉炉。火从脐下升起，水向头顶汇聚。三姓既已会合，二物自然相互制约。固守胎气不泄露，变化就在瞬间。”
庄子内篇，打坐的案例主要两个，一是《齐物论.南郭子綦》，二是《德充符.申徒嘉》。南郭子綦隐机而坐，仰天而嘘，荅焉似丧其耦......译：南郭子綦隐机而坐，仰天长嘘，呼吸若无......“隐机”，存神的意思。打坐是神打坐，不是“我”打坐，心不动神不出，是隐机，“吾丧我”。
炼精化气是内丹术的精华，火候则是精华中的精华。这里简单地从火候的角度来叙述。在凝神入气穴做得比较好，在一意驭二气做得比较好，入静能达到“恍兮惚兮”，下丹田里的内气迅速增加，下丹田里的内气充盈到一定程度，内气会扩散到阴部，阴部会有“痒生毫窍”的效验发生，称作“一阳生”。
