一个身穿制服的人领头，有礼貌地对吴石说:“吴次长，我们需要你协助调查一些事情，请您配合我们。”吴石立刻停止了挣扎，他走向孩子们，轻抚了一下六岁儿子的头，安慰他，然后对稍大的女儿说:“别害怕，爸爸要前去处理一些事情，你要好好读书，照顾好你弟弟。”
1949年8月16日清晨，吴石携家眷乘军用飞机在福州上空盘旋，而后往东南方向离去。而此时，他的挚友何遂根据组织的安排已在台湾执行任务，等待与他会合，谋划策应中国人民解放军南下大军，实施重要军情、阵前起义等要事。
南京大学图书馆内，经济系学子吴韶成还是和往常一样，坐在书桌前静静翻阅着英文报纸《字林西报》，突然，一个豆腐块大的报道刺入了他的眼睛。一遍、两遍、三遍，他反反复复地盯着这篇短小的报道，每读一遍心里就像是多被投掷了一块巨石，把他压得喘不过气来。
1950年6月12日新华社上海分社发行的《参考材料》第三七一号以《伪高级官员数名遭杀害》为题刊登了有关电讯:“台北讯:前参谋次长吴石、前第四兵站总监陈宝仓、前陆军上校聂曦及匪政工干部女匪干朱谌之等四犯已触犯惩治叛变条例，经高等军法会审讯终结，依法判处死刑亦经最高当局核准，已于十日下午四时将四犯提询宣判，随即绑赴刑场执行枪决。
正如江南在《蒋经国传》中所说:“吴石在台湾的特工工作，遍及东南长官公署、保定司令部和空军部队。”对吴石向我党提供情报的重要性，李资生在《台湾大间谍案破获始末》文中也不能不承认吴石“忠诚过度”，指出:“吴石是一个忠诚过度的情报员，他以参谋人员的立场，猜测中共目前需要的情报，而加以有意的收集。
