Cryopreservation of human cancers conserves tumour heterogeneity for singlecell multi-omics analysis。
笔者解析的这篇文章发表在2018年的Science上,文章的逻辑思路清晰,实验证据充实可靠,很多分析思路值得借鉴,堪称单细胞领域的一篇范文。笔者不会详细介绍文中有哪些具体发现(what),而是将主要精力集中在样品制备和数据分析上,介绍本文如何做出这些发现(how)。
在人类基因组计划完成后,人类初步掌握了遗传的“密码本”,但时至今日,我们尚未能一窥自己的细胞图谱。近日,专注高通量单细胞测序解决方案的创新公司万乘基因发布了10K Genomics单细胞测序仪PerseusTM,配套的高通量单细胞转录组芯片及试剂、高通量单细胞表观组学芯片及试剂也同步上市。
单细胞测序已成为生物医学领域的关键共性技术。然而,由于缺乏高效的手段降低“假单细胞率”,主流微流控平台的单通道细胞通量通常在1万细胞以下,空载率达到90%以上,且成本高昂,限制了对数百万个细胞或上千例样本的人群队列进行大规模研究。
Mean Reads per Cell。每个细胞测到的平均reads,一般是Number of Reads 除以Estimated Number of Cells的数值,至少测到20K reads才能反映真实的细胞状况,比较好的数据推荐测到30k reads/cell以上。
2021年10月6日,BICCN在Nature上同时发表16篇文章,公布了初期研究成功,同时还配发了一篇Johan Winnubst和Silvia Arber的观点文章A census of cell types in the brain’s motor cortex。
近日,首都医科大学附属北京妇产医院岳文涛教授团队在分子生物学权威杂志《Journal of Translational Medicine》上发表题为“Single-cell transcriptomics in ovarian cancer identify a metastasis-associated cell cluster overexpressed RAB13”的论文。