鸡舍一般的消毒程序安排如下:清理干净鸡粪后，用水冲洗干净、晾干后，用2%~3%烧碱泼洒地面及1米高墙体，1—2天后用水冲洗、晾干后再用0.3%消毒水喷洒，1—2天后，用0.1%双季胺碘喷洒1—2天用20%生石灰水泼洒地面及1米高的墙体，空置3—5天后进苗。
秋冬季气温日渐降低，空气湿度下降，光照时间缩短、强度减小，这一切自然变化给许多病原微生物提供了良好的生存环境，为此养鸡场秋季消毒显得尤为重要。带鸡消毒是为了保持鸡的健康，防止鸡生产性能下降，杀死舍内各种病原微生物。鸡舍内的羽毛、废料、尘埃与病原微生物并存。
