学校创建于1956年，由上海第一医学院分迁来渝组建，原名重庆医学院，1985年更名为重庆医科大学。学校是国务院学位委员会批准的首批具有博士和硕士学位授予权的单位，教育部批准的首批来华留学示范基地， 2015年成为教育部、国家卫健委和重庆市人民政府共建高校。
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西南地区，包括重庆市、四川省、贵州省、云南省、西藏自治区5个省市区，拥有四川大学、重庆大学、电子科技大学、云南大学等我国重点大学，是考生和家长在高考、考研中目标院校所在地的优选。那么，对于西南地区的医学院校而言，哪些医学院校的综合实力相对较强呢？
全国规模最大的儿科医师培养基地、全国儿科住院医师规范化培训示范基地、儿科学国家级继续教育基地、教育部高等学校儿科专业教育分委员会副主任委员单位……在重庆，有一所医院享誉全国、闻名海外。它就是我国著名的四大儿科系之一——重庆医科大学儿科学院（附属儿童医院）。
在高校合并改名的浪潮中，我国曾经的北京第二医学院、上海第二医学院、天津第二医学院都有了新身份；随着高等教育的发展，以第二命名的医药类本科院校又回到了大众的视野里，比如新疆医科大学厚博学院转设为新疆第二医学院，潍坊医学院改为山东第二医科大学等范例；正在筹建的重庆第二医学院和安徽第二
