近年来，禁止秸秆焚烧政策对改善大气质量发挥了积极作用，但也被认为带来了农作物病虫害加重、化肥农药用量增加等问题。目前，已有浙江、广西及湖南长沙和衡阳等多地探讨或实行了允许有条件焚烧秸秆的政策，包括争取允许发病稻田秸秆有条件田间焚烧等。
在今年全国两会上，多名代表委员提到了“秸秆焚烧”不宜全面禁止，因为这导致了农作物的病虫害加重。国际农业教育科学院院士、黑龙江省农科院原院长、二级研究员韩贵清在接受新京报记者采访时表示，秸秆焚烧不会造大气污染，而且有助于抑制病虫草害，增加粮食产量。
每年到夏收和秋收季节，农作物秸秆的处理就成为各地农民的一件大事，现在又到了一年一度的小麦收割季节，小麦收割后秸秆的处理是多年来种植小麦农户的一道难题，过去小麦收割后的小麦秸秆是一把火燃烧掉，既可以消灭秸秆中的病菌和害虫虫卵，又可以为农田增加一定数量的草木灰肥料。
秸秆禁烧已经有很多年头了，国家发现如果一直禁烧秸秆，给农民朋友种地带来很多麻烦。比如秸秆虽然可以粉碎还田，但是因为没有发酵，造成种子无法保水保墒，影响产量。同时，因为要处理秸秆还会给农民朋友带来很大费用。还有，因为不烧秸秆，田地里的害虫和草种子会继续繁衍。
