四野第46军是从东野第9纵改称而来的。第9纵的前身是冀热辽军区的主力部队冀东纵队(又称詹才芳纵队)。1947年5月,冀东纵队改归东北军区建制后,改编为东北民主联军第9纵队,1948年3月又改称东野第9纵队,11月改称为四野第46军。
1978年7月,46军在江苏徐州住满三年后,又进行第二次调防。部分官兵思想不通,有的人认为从吉林到徐州刚刚稳定下来,感觉徐州这个地方吃、住还不错,也适应了这里气候环境、生活习惯,又要折腾搬家,特别是那些正与地方女青年谈恋爱的年轻干部更不愿意走。
据《吉林市军事志》记载,在新中国成立后的吉林大地上,先后有番号分别为3167、81076、81312、81874、81112、81034、空军39560、3380、81880、吉林省军区独立第三团等部队驻扎。