即在碱性 pH 下，DNA 分子均变性，恢复中性时，线性染色体 DNA 由于两条链分开且 基因组分子量大，单链互相无规则缠绕，不能准确复性，就与其他成分共沉淀，而质 粒 DNA 分子小且两条闭合环状分子即使变性也较紧密的缠绕在一起，准确复性而留于上清溶液中。
一、碱变性法提取质粒DNA质粒（plasmid）是细菌染色体外能自主独立复制的双股环状DNA，带有遗传信息，可赋予细菌某些新的性状。将质粒指纹图谱分析方法、质粒DNA探针技术及检测质粒的PCR技术用于临床感染性疾病的诊断和流行病学调查已成为现实。
实验过程1、实验试剂溶液Ⅱ0.2Ml NaOH / 1% SDS；异丙醇，无水乙醇，75%乙醇应放-20℃冰箱预冷备用；酚氯仿放4℃冰箱预存；菌液12000rcf离心5min，弃掉上清，加入0.2ml溶液I，充分混匀后，加入0.25ml溶液II，颠倒混匀，室温放置5min，加入0
