但当时及战后至今，对美国在日本投掷原子弹这一人类史上仍属第一次的军事行动，还存在着争议。1939年1月25日，美国哥伦比亚大学物理实验室在费米的指导下，用回旋加速器进行了铀裂变试验，证实了犹太女物理学家莉泽.迈特纳的试验结果:即每裂变一个原子可以放出大约2亿电子伏的能量，如能把铀控制利用，其爆炸力在理论上约等于 TNT 炸药的2000万倍。
曼哈顿计划谁也想不到，没有运往日本的第三颗核弹，会害死美国多名科学家。1945年，自从日本偷袭了珍珠港以后，怒不可遏的美国也加入了战场，发誓要让日本付出相应的代价。8月6日和8月9日，是日本有史以来最难忘的两天，美国飞行员载着两颗原子弹，分别投放到了广岛和长崎两个地方。
二战中，美国向日本的广岛和长崎投掷核弹，造成无数平民死亡或终身残疾。像美国这样使用大规模杀伤性武器进行无差别屠杀，把日本人当蚂蚁一样用开水烫，这种灭绝人性的暴行为什么得不到审判？战局、胜负已定，为什么美国不能用更人道主义的方式去结束战争，而非要兽性大发、残害人类？
1945年夏，日本败局已定，但日本政府于7月28日拒绝接受《波茨坦公告》。8月6日和9日，美国先后在日本广岛和长崎各投下一颗原子弹，两地共死伤20多万人。为什么现在日本岛还有美军值守？日本人民难道不恨美国人吗？为什么还要在军事防御上与美国人绑在一块呢？
