CBA常规赛最后一场，南京同曦队客场108:118不敌山西男篮，最终以23胜23负的成绩完成了本赛季的常规赛征程，23胜追平了球队常规赛的最多胜场数，上个赛季球队也拿到了23胜，不过上个赛季CBA常规赛是52轮，这个赛季只有46轮，所以南京同期队本赛季的胜率要比上个赛季高，刚好达到50%，这也是球队历史上第一次常规赛胜率达到五成。
“第四节我们的打得像‘X’一样。”能够把从北京大学走出来的赵柏清逼得在赛后发布会爆粗口自嘲，可想而知，在12月21日2024-2025赛季CBA常规赛第20轮迎战广州男篮的比赛中，最终以112比109惊险获胜的南京同曦，究竟在主场打出了怎样糟糕的表现。
北京时间3月18日晚，CBA常规赛展开第36轮较量。带着此前客战两连败战绩回到主场的南京同曦，迎来了季后赛席位直接竞争对手山西队。最终，在全场大多数时间处于领先的同曦，在最后一节惨遭山西逆转，以114比119吃到三连败。
3月14日，在林葳、赵柏清两位重要球员无法出战的情况下，南京同曦打出了本赛季 CBA 常规赛三阶段以来最好的一场比赛，漂亮利落地以99比93击败老对手浙江男篮。赛后，很少在新闻发布会现场表达太多情感的同曦主帅贝西诺维奇也扬起嘴角连声感慨：“Nice win！Nice win！
北京时间3月20日晚，本赛季CBA常规赛第37轮迎来一场“天赋对决”。最终，坐镇主场的同曦以95比101不敌超新星崔永熙率领的广州队，无奈吃到联赛四连败。“天赋对决”林葳显疲态联赛第三阶段恢复主客场以来，同曦关注度的一路飙升，与小将林葳的连场超神表现紧密相关。
北京时间3月31日，2024-2025赛季CBA常规赛尘埃落定。南京同曦最终以21胜21负的战绩位列常规赛第12名，队史首次晋级季后赛，结束了长达11年的“陪跑”历史。即将到来的季后赛首轮，同曦的对手将是实力强劲的新疆男篮。
北京时间3月11日，在CBA常规赛第39轮进行的一场关键对决中，南京同曦队坐镇主场，在上半场表现不佳的情况下，最终以106比97逆转击败卫冕冠军辽宁男篮，完成赛季双杀。值得一提的是，本场比赛也是前同曦本土双核之一的王岚嵚，在本赛季以租借形式加盟辽宁男篮后，首次回到南京参加联赛。
7月31日讯，据《扬子晚报》记者报道，同曦队确定将签下两位来自NBA的外援，他们是上赛季效力于步行者队的约瑟夫-杨（26岁）和效力于魔术队的阿德里安-佩恩（27岁），这两位当打之年的球星，能帮助同曦队在下赛季闯进季后赛吗？
